Возникновение Избранной рады относят ко времени между 1547 и 1549 г., связывая начало ее формирования с появлением в окружении молодого царя сначала А. Адашева, а затем попа Благовещенского собора Московского Кремля Сильвестра. Иван Грозный вполне определенно говорит о том, почему приблизил Адашева и Сильвестра. Он нуждался в людях, на которых можно было положиться как на советников, поскольку доверия к прежнему окружению у него не было. Также в состав Избранной Рады вошли митрополит Макарий, Иван Висковатый и князь Андрей Курбский. Они служили царю поддержкой и были советниками в его реформаторских начинаниях.

Вместе с Избранной Радой Грозный провел реформы, направленные на централизацию – губную, земскую, военную. В 1549 году был созван Земский собор, в 1551 – Стоглавый, на нем приняли свод решений о жизни церкви – «Стоглав». В 1550 году оформился новый Судебник, единый сборник законов, а также сформировалась цельная система органов исполнительной власти. В 1555-56 годах Иван IV принял Уложение о службе и отменил кормления.

Во времена властвования в Избранной Раде Сильвестра и Алексея Адашева влияние молодого царя было ограничено сильной властью бояр. Они предопределяли решение судебных дел, назначали на должности вплоть до высших ступеней. Они фактически сместили царя, который беспрекословно подчинялся их указаниям и советам. Пока власть сосредотачивалась в руках Избранной Рады, советники были заинтересованы поддерживать "имидж" Ивана Грозного как благочестивого и великого правителя. Деятельность Избранной Рады в историографии оценивается положительно, как время успешных реформ и военных побед. Возникает впечатление, что негативный характер дальнейшей деятельности царя связан именно с тем, что Избранная Рада утратила влияние на государственные дела.

Но главная причина разрыва с прежними советниками кроется в различном видении развития страны. Избранная Рада хотела постепенных реформ, а Иван Грозный мечтал о быстрых преобразованиях, которые могли бы обеспечить ему полную самостоятельность в принимаемых решениях и управлении государством.

1564 год стал для Руси неудачным: пожары в Москве, угрозы нападения с севера и юга, неурожай. В это же время оппозиция решила воспользоваться тяжелой ситуацией и отстранить Грозного от власти, созвав "церковно-государственный собор". Потрясения и неудачи изменили нрав Ивана Грозного. Он и до этого не был самым милостивым государем, то ситуация изменилась: подозрительность Грозного выросла в разы и стала его подругой по престолу. В каждом боярине он видел изменника, предателя.

Он осознавал свое одиночество, не было больше рядом людей, которым царь мог доверять, тем, для кто готов был бы ставить интересы государства выше частных. Бояре не хотят считаться с его мнением, ища в государственных делах личной выгоды, строят против него заговоры, или вовсе бегут из государства.

Одиночество на престоле и вопросы о дальнейшем развитии страны подтолкнули Ивана Грозного на мысль об укреплении самодержавия. Фактически, самодержавие на Руси сложилось еще во времена правления Василия III, однако только при Иване Грозном статус царя был закреплен официально. Деятельность Избранной Рады, по уверениям царя, вела к захвату его власти и возвращению к старым порядкам, существовавших в прошлом.

Царь сбегает из Москвы в Александровскую слободу, откуда присылает два письма. Первое письмо адресовано верхам, которых Грозный обвиняет во всех бедах и самоуправстве. Второе письмо адресовано низам, которых он успокаивает и говорит, чтобы они ничего не опасались. Народ начинает негодовать – решено отправить бояр вслед за царем и умолять вернуться. После долгих переговоров Иван Грозный выставляет два условия: предоставление ему неограниченного суда и разделение страны на опричнину и земщину. И если в земщине сохранялись старые порядки, то в опричнине вводился особый режим. На её территории отменялись традиционные права и привилегии родовой аристократии. Критиковавшие царя лица подвергались репрессиям. Опирался Иван Васильевич на особую силовую структуру — корпус опричников, который по своей структуре напоминал монашеский орден. Именно он должен был покончить с "боярской крамолой".

Опричнина – это попытка государя прибрать всю власть к своим рукам и усмирить бояр, а также месть за все обиды, принесенные близкими ему людьми. И в таком случае она оказывается не сумасбродством царя, а четкой и выверенной политикой по установлению новой феодальной иерархии.

Целью Ивана Грозного было установление централизованного государства благодаря усилению царского самодержавия, а деятельность Избранной рады вела к ослаблению русского централизованного государства, к свержению самостоятельной власти и возвращению социально-политической ситуации прошлого в стране. Разные позиции во взглядах привели к разности мнений между Избранной Радой и Иваном Грозным.

Время Избранной рады стало последней фазой "боярского правления". Пресек эту попытку царь Иван Грозный с помощью опричнины, идеологическая подготовка которой во многом стимулировалась деятельностью Избранной рады.